> Panele dają max <20V, kontroler wytrzyma max 100V
> Będzie różnica w wydajności w zależności od podłączenia? Wolałbym
> szeregowo, trochę mniejsze prądy będą pływać, a przewód między panelem a
> kontrolerem musi kilka metrów mieć...

kluczowa dla ciebie sprawa to mniejszy prąd i to tylko o to chodzi. Może
być jeszcze różna sprawność kontrolera w zależności od napięcia ale to
będą raczej pomijalne wartości.

robiłbym szeregowo.